Una vez superada la difícil misión en el país de la ola, Naruto y sus compañeros de equipo al igual que muchos miembros de la villa se sorprenden ante la llegada de multitud de ninjas de otras aldeas y países, todo esto se debe al examen de Chuunin que se va a celebrar en la aldea.
El examen consiste en 3 partes: una teórica en la cual para superarla tienen que copiar, pero sin ser vistos por los examinadores y por el responsable Morino Ibiki, situación de la cual se dan todos cuenta, excepto Naruto que aprueba sin responder nada.
La segunda consiste en entrar en el bosque de la muerte, para superar dicha prueba a cada equipo se le da 1 pergamino, y existen 2 el del cielo y el de la tierra, dichos pergaminos no se pueden abrir hasta que no se halla llegado a la torre. Poco a poco los equipos van siendo eliminados y el equipo de Naruto es atacado varias veces, destacando cuando es atacado por el asesino Orochimaru el cual busca a Sasuke, aunque sin saber sus intenciones, Sasuke al igual que Naruto pierde el conocimiento por la batalla, aunque Sasuke queda marcado por el sello maldito. Sakura entonces, tiene que proteger a sus compañeros de los miembros del equipo del Sonido que buscan a Sasuke, pero gracias a la ayuda de Ino, Shikamaru, Chouji y Rock Lee consiguen alejar momentáneamente a dicho equipo.
Una vez superada esa situación emprenden el camino hacia la torre, pero aun les falta un pergamino así que venciendo a un equipo cerca de la torre consiguen superar dicha prueba.
Dado el alto número de equipos que ha superado dicha prueba, tienen que hacer unos combates preliminares. El primer combate enfrenta a Sasuke con Yoroi, Yoroi absorbe el chakra de Sasuke y este solo puede vencerlo usando taijutsu para no malgastar tanto chakra, lo consiguen gracias a los movimientos que había copiado con anterioridad a Rock Lee. Los siguiente combates fueron Tenten contra Temari, Ino contra Sakura, Hinata vs. Neji, Shino vs. Zaku, Kin vs. Shikamaru, Kankuro vs. Zouri, Chouji vs. Dosu, Kiba vs. Naruto. Tras un largo combate contra Kiba, Naruto acaba demostrando al resto su poder dejando a todos de piedra sobretodo a sus compañeros de clase, y le vence.
Tras esto llega finalmente la ultima prueba, que es un combate por eliminares en el estadio de Konoha. Los primeros combates son Neji vs. Naruto, Shikamaru vs. Temari, pero el resto se suspenden a excepción del esperado Sasuke vs. Gaara. Naruto gana con bastantes problemas a Neji, viéndose el Uzumaki obligado a usar el poder del Kyubi; Shikamaru demostrando ser un gran estratega logra vencer a Temari y finalmente el combate más importante el último Uchiha contra el genio de la Arena.